印度研究人員對公共數據庫中可用的約4000個SARS-COV-2（冠狀病毒）序列進行了廣泛的研究，包括在印度測序的菌株，而其他研究主要針對基因組方面，在JamiaHamdard的研究已經評估在印度和全球場景中，基因組和致病病毒的功能方面。大規模基因組和功能分析顯示了一些蛋白質的顯著變化。它還突出了保守的蛋白質，可以靶向潛在的診斷和乾預候選者。
截至今日，印度-第七大國家，其中第二大人口報告僅2％的案件，並在全球Covid-19由於Covid-19而導致的0.9％。雖然全球死亡人數為每百萬百萬人死亡，但印度已有2百萬人死亡。
研究人員來自Hasnain的實驗室教授的可能原因（副校長）在新德里（印度）賈米亞哈德德（印度），劍橋（英國）＆EnvirozymeBiotech，海德拉巴（印度），劍橋（印度），合作，以了解印度Covid-19大流行的步伐。該集團是印度首批分析如此大規模數據集，以研究該國（冠狀病毒）SARS-COV-2的演變。
在印度冠狀病毒基因組中的開放閱讀框架
開放閱讀框架（ORF）（讀取框架的一部分，具有能夠翻譯的，並且具有從一個開始開頭的連續密碼子。密碼子和終止密碼子的末端）負責在生物體中產生的蛋白質產生。已發現SARS-COV-2具有12個ORF。
在進化期間，病毒突變（DNA的變化）並演變以存活。基於這些ORF的突變分析，印度菌株可以廣泛分為三個亞型。與原來的武漢分離物相比，印度分離物中的ORF1a已經分叉多於全局平均值。
orf1a是一個聚丙烯，其用於非結構蛋白（NSP）的代碼扮演一個重要的蛋白在宿主免疫調節中的作用。Hamdard收集的數據提出了印度分離株中的重要突變，這可能影響SARS-COV-2在印度人群中的感染性。
印度和歐洲菌株有些類似：研究人員
基於整個基因組相似性，印度樣品落入三組。印度樣本的基因組相似性揭示了與中國，科威特，西班牙，挪威和加拿大的靠近，暗示由於這些國家的旅行歷史進入印度的旅遊歷史。
初始菌株來自中國，但在2020年2月初的旅行禁令似乎阻止了直接從中國到印度亞大陸的大規模洩漏。然而，由於其他亞洲地區的不受限制的旅行，那些菌株仍然似乎是間接傳播的，因為它們落在同一群體中。
印度測序的菌株最高與歐洲菌株的相似程度。這表明來自歐洲熱點地區的延遲旅行限制似乎影響不僅影響了印度而且是許多國家。該組觀察到研究病毒的演變對於對抗它至關重要。突變模式和菌株（印度）的分歧與全球趨勢大大一致。一些蛋白質從原來的武漢菌株分化。
菌株的多樣性可能是好的或壞消息-這種突變可能對毒力和傳輸速率的影響尚未評估。
更多這些研究是為了了解病原體的爆發動態，最終會導致對疾病的減輕。較低的採樣率和較少數量的基因組提交被確定為評估印度冠狀病毒（SARS-COV-2）演變中的主要瓶頸。
jamia哈德德希望政府努力提高采樣率，同時增加基因組提交。病毒菌株的快速和多樣化序列將有助於研究人員發現更好的診斷探針導致更高的靈敏度和特異性，改善藥物療效和廣譜Covid-19疫苗。
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